232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3724 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  66.58 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  52.19 
 
 		 404 aa  301  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  47.91 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  47.91 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  47.91 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 402 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 402 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  47.64 
 
 		 402 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  47.4 
 
 		 403 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  47.4 
 
 		 403 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  47.4 
 
 		 403 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  47.12 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  47.12 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  50.71 
 
 		 414 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  40 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  42.67 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  40.05 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  40.05 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  40.05 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 388 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  34.29 
 
 		 502 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  45.98 
 
 		 282 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  47.88 
 
 		 182 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.9 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.48 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  29.78 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.09 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  32.64 
 
 		 207 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.48 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  29.9 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>