221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0396 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 373 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  95.17 
 
 		 403 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  83.38 
 
 		 403 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  80.16 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  79.09 
 
 		 372 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  78.71 
 
 		 402 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  78.55 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  78.55 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  78.71 
 
 		 402 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  78.71 
 
 		 402 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  78.98 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  78.98 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  78.71 
 
 		 402 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  78.55 
 
 		 451 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  78.02 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  79.09 
 
 		 405 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  79.36 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  51.07 
 
 		 400 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  50.54 
 
 		 369 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  49.32 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 441 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  37.5 
 
 		 384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.71 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 388 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.03 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2828  major facilitator transporter  79.09 
 
 		 112 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  32.69 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 405 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.76 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  36.16 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  32.94 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.72 
 
 		 432 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  33.63 
 
 		 392 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.1 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  34.45 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  34.11 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  36.93 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  33.92 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.58 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  30.9 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  34.52 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  34.52 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  34.52 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  34.52 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  34.52 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  30.97 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  34.52 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  35.29 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>