216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2464 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
387 aa  773    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 
388 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 
387 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
386 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  36.61 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  34.42 
 
 
386 aa  225  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
390 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  32.22 
 
 
432 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.73 
 
 
400 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  28.34 
 
 
417 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
383 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
402 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
377 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
369 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  27.94 
 
 
384 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
391 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  28.5 
 
 
391 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
378 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
408 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  25.98 
 
 
385 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
391 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  25.98 
 
 
385 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  25.98 
 
 
385 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.01 
 
 
384 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  26.72 
 
 
397 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.91 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.34 
 
 
396 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  30.77 
 
 
400 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  30.47 
 
 
384 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  30.17 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 
379 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
405 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  30.09 
 
 
383 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  27.22 
 
 
397 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  26.74 
 
 
403 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.65 
 
 
451 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  29.13 
 
 
408 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.77 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.42 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.42 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.15 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.42 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.42 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.42 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  27.54 
 
 
378 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.49 
 
 
372 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  28 
 
 
377 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  27.54 
 
 
378 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  27.54 
 
 
378 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 
402 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 
402 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
378 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  27.54 
 
 
378 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  27.42 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  27.27 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  23.69 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  26.89 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  27.46 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  28.86 
 
 
441 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
387 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
396 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  29.56 
 
 
401 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
407 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  27.7 
 
 
409 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  27.25 
 
 
383 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
389 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
397 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 
425 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  31.14 
 
 
384 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  31.14 
 
 
384 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  31.14 
 
 
384 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  26.76 
 
 
403 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  25.72 
 
 
388 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  28.3 
 
 
377 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  28.49 
 
 
377 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  26.56 
 
 
405 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.53 
 
 
462 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
392 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  27.78 
 
 
392 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
433 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  27.15 
 
 
404 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  27.15 
 
 
404 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  26.3 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  27.14 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  29.61 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  26.69 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
389 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  26.97 
 
 
375 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>