245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3589 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  100 
 
 		 383 aa  738    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  95.04 
 
 		 383 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  68.59 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  54.8 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  53.41 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  52.7 
 
 		 386 aa  342  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  53.26 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  53.89 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  55.97 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  44.26 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  44.26 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  44.26 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  44.26 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  44.26 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  43.98 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  43.98 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  43.14 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  48.07 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  48.07 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  45.4 
 
 		 379 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  35 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  36.44 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.57 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  37.09 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.8 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.25 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.73 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  32.41 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.2 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.28 
 
 		 462 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.52 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  30.38 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>