202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6960 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  96.9 
 
 		 387 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  96.9 
 
 		 387 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 384 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 384 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 384 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  37.8 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 392 aa  213  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 379 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  35.01 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  35.01 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  35.01 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  35.01 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  35.01 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  38.63 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  35.01 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  38.63 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  34.92 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  35.63 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.91 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.53 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 397 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  26.24 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.51 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.12 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  31.03 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  26.86 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  26.86 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  26.86 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.62 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32.11 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 470 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  26.4 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>