215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3382 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  90.59 
 
 
439 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  93.89 
 
 
405 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  91.86 
 
 
404 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  91.86 
 
 
404 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  94.15 
 
 
405 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  78.52 
 
 
403 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  80.5 
 
 
451 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  80.75 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  80.75 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  80.25 
 
 
402 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  77.06 
 
 
403 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  80.25 
 
 
402 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  80.25 
 
 
402 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  80.25 
 
 
402 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  83.33 
 
 
372 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  78.02 
 
 
373 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 
383 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  50.54 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  46.84 
 
 
400 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  50.52 
 
 
408 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  51.51 
 
 
373 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  43.73 
 
 
441 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
385 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2828  major facilitator transporter  93.75 
 
 
112 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  37.43 
 
 
384 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  36.54 
 
 
397 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  35.51 
 
 
397 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  35.99 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
388 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
387 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  40.38 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
405 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
386 aa  170  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36.25 
 
 
400 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
407 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
381 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.28 
 
 
396 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.88 
 
 
405 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.98 
 
 
396 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.92 
 
 
391 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  38.87 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
396 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  37.54 
 
 
401 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.95 
 
 
419 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
392 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  32.6 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
387 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
385 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  35.22 
 
 
384 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  36.61 
 
 
398 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.62 
 
 
383 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  33.24 
 
 
393 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.87 
 
 
386 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.09 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  31.62 
 
 
383 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.42 
 
 
386 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.08 
 
 
403 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  34.49 
 
 
377 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  35.52 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.71 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
415 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.65 
 
 
432 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  32.45 
 
 
383 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  33.16 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  33.16 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  33.16 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  33.16 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  33.16 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  33.16 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  34.88 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.01 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  33.06 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  35.48 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
386 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  33.83 
 
 
411 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.81 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  30.67 
 
 
402 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
402 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  30.67 
 
 
402 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  30.67 
 
 
402 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  30.67 
 
 
402 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  30.67 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  30.67 
 
 
402 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  30.4 
 
 
402 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
387 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  31.58 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  31.58 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  32.34 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>