215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5894 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  71.28 
 
 
378 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  71.28 
 
 
378 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  71.28 
 
 
378 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  71.28 
 
 
378 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  71.01 
 
 
378 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  71.28 
 
 
378 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  71.28 
 
 
378 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  71.66 
 
 
377 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  64.53 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  63.73 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  63.73 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  63.25 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  57.78 
 
 
401 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  58.4 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  57.87 
 
 
377 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  50.27 
 
 
384 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
389 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
389 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
377 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  46.88 
 
 
384 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  46.88 
 
 
384 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  46.88 
 
 
384 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 
386 aa  252  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
379 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  45.33 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  45 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
387 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
378 aa  232  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  45.18 
 
 
383 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 
405 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  46.09 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
385 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  40 
 
 
382 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  37.03 
 
 
387 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  36.22 
 
 
387 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  36.22 
 
 
387 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
387 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  36.75 
 
 
396 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
397 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  32.95 
 
 
397 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  37.01 
 
 
441 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.25 
 
 
384 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
388 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.15 
 
 
397 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 
391 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
396 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.71 
 
 
391 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.71 
 
 
393 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.95 
 
 
400 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  38.11 
 
 
419 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.9 
 
 
383 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.46 
 
 
383 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
386 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
390 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.81 
 
 
388 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.3 
 
 
386 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
407 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.05 
 
 
417 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
385 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.66 
 
 
403 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  33.24 
 
 
403 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 
373 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.47 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.07 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  31.55 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  34.66 
 
 
409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  29.33 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.75 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
402 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  29.65 
 
 
393 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  32.09 
 
 
400 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
387 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
470 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.7 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.99 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  32.86 
 
 
405 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  33.6 
 
 
439 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.75 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  32.86 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.61 
 
 
372 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
411 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.88 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.97 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  34.9 
 
 
373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>