227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4705 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 470 aa  859    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.24 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  36 
 
 		 384 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.81 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  39.01 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 381 aa  161  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 388 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 441 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 393 aa  153  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  39.07 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  38.81 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  38.81 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 391 aa  143  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 379 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  36.69 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 383 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  36.69 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  36.69 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  36.69 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  36.69 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  36.69 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  35.07 
 
 		 393 aa  140  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 405 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  39.13 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  36.41 
 
 		 378 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 369 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.22 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  35.17 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 379 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 465 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  37.85 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  36.87 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1120  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.44 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.64 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  40.16 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.78 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.53 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.64 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.87 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  31.25 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  37.11 
 
 		 403 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>