209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3180 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  820    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  47.79 
 
 
502 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 
480 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  53.66 
 
 
464 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  46.61 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 
413 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 
425 aa  269  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 
413 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  44.05 
 
 
388 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  46.32 
 
 
400 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
427 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 
397 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  42.42 
 
 
404 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 
433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  42.86 
 
 
417 aa  203  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
402 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
409 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  32.11 
 
 
397 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 
397 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  32.9 
 
 
397 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  39.57 
 
 
404 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  35.84 
 
 
402 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  35.58 
 
 
402 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  35.58 
 
 
402 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  35.58 
 
 
402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  35.58 
 
 
402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  35.58 
 
 
402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  34.13 
 
 
404 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  42.51 
 
 
404 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  35.32 
 
 
402 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  39.95 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
401 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  32.41 
 
 
397 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  32.41 
 
 
397 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  32.41 
 
 
397 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  34.05 
 
 
403 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  34.05 
 
 
403 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 
391 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  34.05 
 
 
403 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  34.05 
 
 
403 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  34.05 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  32.47 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  35.52 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
398 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  33.77 
 
 
414 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
423 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  29.46 
 
 
391 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.41 
 
 
417 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  35.58 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
391 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
387 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.52 
 
 
383 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.27 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  25.55 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  30.16 
 
 
383 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  34.36 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  33.15 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  33.92 
 
 
414 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  33.33 
 
 
399 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
399 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  33.33 
 
 
399 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  28.3 
 
 
397 aa  114  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
386 aa  113  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
369 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.12 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  32.17 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.4 
 
 
403 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.93 
 
 
386 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.81 
 
 
386 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
435 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
394 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
381 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  27.49 
 
 
397 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
394 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  31.76 
 
 
428 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 
470 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
411 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  28.61 
 
 
391 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  27.88 
 
 
384 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  32.41 
 
 
462 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  32.6 
 
 
414 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.79 
 
 
398 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
407 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.01 
 
 
400 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
394 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
387 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
402 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  33.42 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.45 
 
 
396 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>