226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  100 
 
 		 387 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  72.78 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  64.54 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  68.65 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  62.98 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  61.64 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  61.64 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  61.64 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  57.91 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 		 439 aa  305  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  57.22 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  45.09 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  44.83 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  38.81 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  30.81 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.61 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 402 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.34 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.33 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.35 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  29.72 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  29.7 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.85 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 388 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  31.15 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  30.83 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  31.23 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 409 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  28.72 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.99 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 374 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  28.13 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 413 aa  96.3  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>