209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3238 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  100 
 
 
373 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  83.7 
 
 
400 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 
383 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  59.26 
 
 
369 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  61.37 
 
 
408 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  50.94 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  51.48 
 
 
373 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  51.21 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  52.19 
 
 
404 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  52.19 
 
 
404 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  50.81 
 
 
439 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  51.55 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  49.33 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  50.41 
 
 
405 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  50.41 
 
 
405 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
402 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
402 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  48.79 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.79 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.79 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.79 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  48.53 
 
 
451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  44.54 
 
 
441 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
388 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
387 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  41.03 
 
 
400 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  35.96 
 
 
384 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
402 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
405 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.59 
 
 
397 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  41.13 
 
 
393 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.72 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 
379 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.99 
 
 
388 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 
381 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.96 
 
 
396 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
407 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  38.95 
 
 
401 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.26 
 
 
417 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
391 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.55 
 
 
405 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  40.73 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.34 
 
 
391 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
377 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  31.59 
 
 
383 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
396 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 
397 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  32.69 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.88 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  32.51 
 
 
383 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
391 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
408 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  34.34 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  34.34 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  34.34 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  34.34 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  34.34 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  35.88 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  34.07 
 
 
378 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
389 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  34.07 
 
 
378 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.46 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  35.82 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.77 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  36.12 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.54 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.12 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  35.95 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  35.95 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  35.95 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  37.43 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  35.67 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.54 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.88 
 
 
385 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.88 
 
 
385 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  37.29 
 
 
401 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.89 
 
 
386 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
390 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  31.91 
 
 
382 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  31.42 
 
 
392 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
415 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.89 
 
 
447 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  33.16 
 
 
399 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  33.16 
 
 
399 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  33.16 
 
 
399 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>