210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3423 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.95 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 441 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.74 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  31.49 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  33.89 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.14 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 439 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  32.98 
 
 		 408 aa  143  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  29.81 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  32.3 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  29.32 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.49 
 
 		 451 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.71 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.4 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  29.11 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  33.52 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.38 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.17 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.85 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  34.83 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 427 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.79 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>