224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1162 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  100 
 
 
384 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  52.62 
 
 
398 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  49.47 
 
 
403 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
465 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
385 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
387 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.78 
 
 
384 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
383 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.97 
 
 
405 aa  163  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 
369 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
402 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
388 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  38.22 
 
 
388 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.17 
 
 
386 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
381 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
378 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.52 
 
 
397 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
379 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.9 
 
 
417 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 
386 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.55 
 
 
397 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  32.97 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  34.22 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.94 
 
 
400 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  35.6 
 
 
383 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  35.43 
 
 
403 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.72 
 
 
396 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
415 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.29 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.66 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  37.4 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
387 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
373 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
405 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
397 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  34.82 
 
 
392 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  32.04 
 
 
396 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  34.33 
 
 
384 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  35.25 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.87 
 
 
383 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
377 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
392 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  34.14 
 
 
441 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  28.42 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  32.44 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  36.02 
 
 
408 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  32.32 
 
 
428 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  34.17 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.63 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  34.17 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  34.17 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.37 
 
 
402 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.37 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.37 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.37 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.1 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.1 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  28.91 
 
 
403 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  28.91 
 
 
403 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  33.86 
 
 
391 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.1 
 
 
402 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  35.37 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  28.91 
 
 
403 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  36.15 
 
 
403 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  26.78 
 
 
432 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  31.67 
 
 
382 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  30.69 
 
 
413 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  32.4 
 
 
383 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  28.91 
 
 
403 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  28.91 
 
 
403 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.85 
 
 
451 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
394 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
398 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
408 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  29.78 
 
 
375 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  35.01 
 
 
439 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
379 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  32.01 
 
 
388 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 
396 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.36 
 
 
372 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  35.11 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  30.92 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
427 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  31.18 
 
 
447 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>