206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3074 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
413 aa  780    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  51.29 
 
 
396 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 
400 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  37.06 
 
 
393 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
381 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.09 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.87 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  35.38 
 
 
419 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
387 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  33.73 
 
 
403 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  32.52 
 
 
443 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.45 
 
 
398 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
378 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.69 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.79 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.6 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.13 
 
 
386 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.03 
 
 
396 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  29.72 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.77 
 
 
462 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
389 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
397 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.46 
 
 
385 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.74 
 
 
391 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
377 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.88 
 
 
397 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29 
 
 
397 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.62 
 
 
403 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
407 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
389 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  29.52 
 
 
396 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.22 
 
 
385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.22 
 
 
385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
391 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.66 
 
 
409 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  31.65 
 
 
428 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.05 
 
 
414 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
396 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.87 
 
 
400 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
403 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  32.21 
 
 
373 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30.58 
 
 
441 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
386 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
392 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
379 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.08 
 
 
383 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  30.81 
 
 
393 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
435 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  27.62 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  30.11 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
405 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  29.65 
 
 
393 aa  96.3  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.89 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.08 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  29.78 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  27.45 
 
 
382 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
387 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.08 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  29.64 
 
 
405 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  31.05 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.47 
 
 
384 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  30.45 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
369 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  31.1 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  29.38 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  33.03 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  31.1 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
385 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  29.56 
 
 
439 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  40.14 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  29.15 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
408 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.59 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
394 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  28.23 
 
 
384 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  28.23 
 
 
384 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  28.23 
 
 
384 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.53 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
400 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  30.26 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  32.89 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>