233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5723 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
378 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
405 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
377 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  49.2 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  45.48 
 
 
383 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
389 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  47.91 
 
 
384 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  47.91 
 
 
384 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  47.91 
 
 
384 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  41.84 
 
 
383 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  41.58 
 
 
383 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 
387 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
386 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 
379 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  41.23 
 
 
378 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  41.23 
 
 
378 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  41.23 
 
 
378 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  41.23 
 
 
378 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  41.23 
 
 
378 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
392 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  41.5 
 
 
378 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  44.96 
 
 
392 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  42.47 
 
 
377 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  40.95 
 
 
378 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  42.61 
 
 
381 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  42.3 
 
 
389 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  40.22 
 
 
385 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  40.22 
 
 
385 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  40.22 
 
 
385 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 
385 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  42.99 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  42.35 
 
 
401 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
387 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  41.62 
 
 
377 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  35.64 
 
 
387 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  35.91 
 
 
387 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  35.91 
 
 
387 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  40.81 
 
 
377 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  43.02 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
386 aa  199  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  38.67 
 
 
396 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  40.35 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  38.5 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 
391 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
388 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
397 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 
396 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  35.53 
 
 
397 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  30.14 
 
 
386 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  36.24 
 
 
403 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  36 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
379 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
390 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  38.29 
 
 
441 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
383 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  34.75 
 
 
400 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.81 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
369 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
402 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.44 
 
 
391 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 
392 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.84 
 
 
384 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  34.88 
 
 
403 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  36.29 
 
 
383 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  36.53 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  38.78 
 
 
388 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.71 
 
 
383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  32.25 
 
 
408 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.1 
 
 
398 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
373 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.4 
 
 
400 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.77 
 
 
417 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  32.58 
 
 
432 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  36.34 
 
 
419 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
398 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  35.04 
 
 
409 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  34.79 
 
 
439 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
387 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  34.52 
 
 
404 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  34.52 
 
 
404 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  34.14 
 
 
403 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 
415 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  34.43 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  33.98 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  34.7 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
403 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
385 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  38.33 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.92 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.77 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.28 
 
 
396 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  33.78 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.7 
 
 
451 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
411 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>