211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 428 aa  815    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  45.18 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  45.09 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  44.58 
 
 		 414 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  40.35 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  43.72 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 		 421 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.23 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.82 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 387 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.24 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 465 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  35.07 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  28.89 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  33.25 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.59 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  29.84 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.44 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  29.03 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  29.44 
 
 		 502 aa  99.8  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 373 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 443 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 409 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 383 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  26.8 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  26.8 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  26.8 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  29.12 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  26.29 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>