230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4332 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  770    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.22 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  30.95 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  29.28 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  29.16 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  26.52 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  27 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  30.03 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  32.18 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.7 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.7 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  27.82 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.7 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  27.7 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  26.58 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  27.11 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  27.11 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  27.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  27.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  27.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  27.37 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  27.52 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  26.98 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  25.85 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.88 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 464 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  30.81 
 
 		 404 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  27.94 
 
 		 502 aa  96.3  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  26.54 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  26.7 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  27.97 
 
 		 282 aa  93.2  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.03 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  27.14 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>