221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3706 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
390 aa  763    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  45.93 
 
 
402 aa  315  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  45.93 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  45.93 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  45.93 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  45.93 
 
 
402 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  45.93 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  45.67 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  45.67 
 
 
402 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  45.33 
 
 
404 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  45.96 
 
 
375 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  44.18 
 
 
403 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  44.18 
 
 
403 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  44.18 
 
 
403 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  44.56 
 
 
403 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  44.56 
 
 
403 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  45.15 
 
 
404 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  42.49 
 
 
414 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  41.6 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  37.98 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  37.95 
 
 
397 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  36.46 
 
 
397 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  36.46 
 
 
397 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  36.46 
 
 
397 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
395 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 
425 aa  222  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  36.9 
 
 
400 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 
402 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  35.32 
 
 
388 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  41.76 
 
 
282 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  35.68 
 
 
433 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
413 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
413 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
397 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  36.86 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  33.24 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
409 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
423 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 
502 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  44.51 
 
 
182 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  34.67 
 
 
404 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
391 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
433 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.81 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
385 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  29.27 
 
 
384 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
387 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.18 
 
 
405 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.81 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.25 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.53 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  30.38 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  33.96 
 
 
392 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.18 
 
 
432 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  27.75 
 
 
383 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
402 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  30.03 
 
 
400 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
391 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  30.03 
 
 
384 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.16 
 
 
385 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.16 
 
 
385 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  29.26 
 
 
396 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
392 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
394 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.62 
 
 
385 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.33 
 
 
419 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
387 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
386 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
390 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
394 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
379 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  30 
 
 
388 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  26.4 
 
 
398 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  33.33 
 
 
207 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
389 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
388 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  28.46 
 
 
384 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  30.08 
 
 
383 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
378 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  28.34 
 
 
417 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
403 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.48 
 
 
403 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  30.03 
 
 
393 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
405 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>