214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  100 
 
 		 414 aa  786    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  54.97 
 
 		 404 aa  345  8e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  50.79 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  50.79 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  50.79 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  50.53 
 
 		 402 aa  339  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  50.53 
 
 		 402 aa  339  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  50.53 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 404 aa  335  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  51.21 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  51.21 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  51.21 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  50.94 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  51.21 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  52.51 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  51.25 
 
 		 375 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  42.49 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  39.74 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  49.1 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  40 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  40 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  40 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 		 402 aa  229  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  49.43 
 
 		 282 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.5 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 409 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 443 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  47.88 
 
 		 182 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.04 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  34.38 
 
 		 207 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.54 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.63 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  28.8 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  25.53 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 409 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  29.68 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>