204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0704 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  100 
 
 
282 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  47.97 
 
 
402 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  47.97 
 
 
375 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  47.6 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  49.61 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 
395 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  48.28 
 
 
404 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  46.04 
 
 
403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  46.04 
 
 
403 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  46.04 
 
 
403 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  46.04 
 
 
403 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  45.66 
 
 
403 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
398 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
401 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  47.22 
 
 
404 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  41.87 
 
 
390 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 
433 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  42.81 
 
 
427 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  42.75 
 
 
391 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  40.47 
 
 
397 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
425 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  39.69 
 
 
397 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  36.88 
 
 
397 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  36.88 
 
 
397 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  36.14 
 
 
397 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 
402 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  38.41 
 
 
388 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  40.61 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
464 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 
413 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 
413 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  36.12 
 
 
400 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  39.62 
 
 
417 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 
397 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  40.72 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  32.76 
 
 
502 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  36.98 
 
 
433 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
397 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 
409 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
423 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
480 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
443 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
446 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  36.36 
 
 
404 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  37.55 
 
 
433 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
385 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
402 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
391 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 
381 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
411 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
403 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.27 
 
 
397 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
387 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
388 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.95 
 
 
397 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
394 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31 
 
 
384 aa  99  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  31.73 
 
 
419 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
392 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.11 
 
 
383 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
386 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
373 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  35.46 
 
 
400 aa  95.9  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.54 
 
 
383 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  28.4 
 
 
400 aa  92.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  31.42 
 
 
377 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.93 
 
 
403 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.47 
 
 
432 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.14 
 
 
396 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
430 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.89 
 
 
400 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
390 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
394 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.78 
 
 
384 aa  89  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  31.54 
 
 
392 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
397 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.65 
 
 
391 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.2 
 
 
396 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
396 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
394 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  28.28 
 
 
398 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  28.63 
 
 
382 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  30.04 
 
 
383 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.41 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  24.6 
 
 
405 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1120  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  30.63 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  30.4 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>