222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0840 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  40.52 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  40.52 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  40.52 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  40.52 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  40.52 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  40.21 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  41.19 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  44.65 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  39.63 
 
 		 377 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 384 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 384 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 384 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  43.3 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 386 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 385 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  37.77 
 
 		 384 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  39.63 
 
 		 383 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  37.67 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.7 
 
 		 397 aa  176  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 391 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.97 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 405 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.07 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.35 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.96 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.22 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  36.41 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.06 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.26 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.7 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 385 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.73 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  30.28 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.68 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>