247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1567 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  100 
 
 
392 aa  715    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  55.97 
 
 
383 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  56.76 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  57.3 
 
 
383 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  50.92 
 
 
386 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
392 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  50.65 
 
 
377 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  52.43 
 
 
384 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  47.15 
 
 
389 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 
379 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 
378 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 
389 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  49.73 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  49.73 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  49.73 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  47.52 
 
 
382 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  45.51 
 
 
385 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  44.69 
 
 
378 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  44.54 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  44.54 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  44.54 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  44.54 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  44.54 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  44.38 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  44.38 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  44.26 
 
 
378 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  45.45 
 
 
389 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  48.79 
 
 
401 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  49.47 
 
 
377 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  41.01 
 
 
387 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  48.67 
 
 
377 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  40.69 
 
 
387 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  40.69 
 
 
387 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  43.82 
 
 
377 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 
405 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  46.24 
 
 
379 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  38.83 
 
 
384 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  35.97 
 
 
397 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  35.77 
 
 
397 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
386 aa  182  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
387 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
397 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  36.46 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
388 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  39.55 
 
 
383 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  39.83 
 
 
383 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  38.32 
 
 
386 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  40.11 
 
 
441 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
379 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  42.53 
 
 
393 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  36.97 
 
 
403 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.69 
 
 
391 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  38.15 
 
 
392 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
402 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
391 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  37.04 
 
 
384 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.56 
 
 
386 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 
369 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  37.66 
 
 
403 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.34 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  40.89 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  33.96 
 
 
390 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
387 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
407 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.29 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
387 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  37.37 
 
 
408 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
403 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  34.41 
 
 
396 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.07 
 
 
405 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
373 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  31.74 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  34.49 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.27 
 
 
451 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.81 
 
 
398 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  35.26 
 
 
404 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
402 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
402 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.61 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.33 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  37.66 
 
 
419 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  36.16 
 
 
409 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  32.89 
 
 
411 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  29.65 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  38.44 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  33.79 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
411 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>