216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3793 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  99.47 
 
 
377 aa  699    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  100 
 
 
377 aa  703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  88.17 
 
 
401 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  59.47 
 
 
378 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  59.47 
 
 
378 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  59.47 
 
 
378 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  59.47 
 
 
378 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  59.47 
 
 
378 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  59.2 
 
 
378 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  59.2 
 
 
378 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  58.87 
 
 
377 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  58.36 
 
 
389 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  52.66 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  52.39 
 
 
385 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  52.39 
 
 
385 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
389 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
389 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 
377 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  52.17 
 
 
384 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  55.77 
 
 
379 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  51.75 
 
 
384 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  51.75 
 
 
384 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  51.75 
 
 
384 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 
392 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 
379 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  48.35 
 
 
383 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  50.69 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
387 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  48.34 
 
 
383 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  47.11 
 
 
386 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
378 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 
405 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  49.47 
 
 
392 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  38.75 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  38.75 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  38.63 
 
 
387 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
385 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  40.7 
 
 
382 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  31.87 
 
 
386 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
381 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
388 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  38.44 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  37.26 
 
 
396 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
379 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
387 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  37.14 
 
 
383 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  32.76 
 
 
397 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  38.38 
 
 
441 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.05 
 
 
397 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  36.29 
 
 
383 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
391 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 
407 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
397 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.77 
 
 
391 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  40.91 
 
 
400 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 
396 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
387 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  35.51 
 
 
403 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
383 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 
369 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
373 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.46 
 
 
417 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 
385 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
390 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  41.27 
 
 
393 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.51 
 
 
398 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  36.9 
 
 
400 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  37.02 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  36.16 
 
 
403 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
415 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.51 
 
 
392 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.15 
 
 
408 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.69 
 
 
392 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.34 
 
 
405 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.54 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.25 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  36.34 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  32.16 
 
 
393 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  31.35 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
387 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  34.15 
 
 
404 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  34.15 
 
 
404 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  36.16 
 
 
405 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  34.28 
 
 
409 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  35.89 
 
 
405 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  33.33 
 
 
404 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.58 
 
 
451 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.61 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.86 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  35.16 
 
 
439 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  33.16 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  30.17 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
398 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.77 
 
 
384 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>