217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0228 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  99.74 
 
 		 378 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  100 
 
 		 378 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  99.74 
 
 		 378 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  99.74 
 
 		 378 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  99.21 
 
 		 378 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  99.74 
 
 		 378 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  99.74 
 
 		 378 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  87 
 
 		 377 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  72.18 
 
 		 389 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  63.66 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  63.66 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  63.66 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  60.27 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  60.85 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  59.2 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  60.27 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  43.98 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 405 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.53 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 386 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.64 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  35.62 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  35.13 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.06 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  30.77 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.91 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  30.39 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.62 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  30.7 
 
 		 408 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.34 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.19 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.4 
 
 		 432 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.89 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>