234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1499 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 379 aa  723    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  61.41 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  54.5 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  54.62 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  55.98 
 
 		 383 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 		 392 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  48.53 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  46.09 
 
 		 389 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  44.75 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  44.75 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  44.75 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  44.75 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  44.75 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  44.48 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  44.48 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  51.07 
 
 		 392 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  48.95 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  46.84 
 
 		 401 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  47.06 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  43.2 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 405 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 396 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  35.26 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.11 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  35.58 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.64 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 441 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.01 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  35.03 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  30.99 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.61 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  33.51 
 
 		 393 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.06 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.28 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  30.37 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  30.37 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1120  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>