212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1180 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  713    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  40.79 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  39.78 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  46.52 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  39.78 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  38.73 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 400 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  38.74 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  40.17 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  40.17 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  38.95 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  41.15 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  34.24 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  37.5 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.21 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  37.78 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  37.78 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  37.78 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  37.78 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  37.78 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  37.78 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  39.84 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  40.93 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  37.5 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39.31 
 
 		 451 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 470 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 387 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  42.93 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  38.14 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 408 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  35.86 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>