211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0206 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  91.07 
 
 		 439 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  93.38 
 
 		 405 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  93.13 
 
 		 405 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  91.86 
 
 		 409 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  78.38 
 
 		 403 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  79.55 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  77.61 
 
 		 403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  79.8 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  79.8 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  79.3 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  79.3 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  79.3 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  79.3 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  81.99 
 
 		 372 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  78.55 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 		 383 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  50.25 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2828  major facilitator transporter  91.07 
 
 		 112 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  36.68 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.26 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 381 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.53 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  37.95 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.55 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.76 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  37.56 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.19 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 419 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  33.52 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.6 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  30.62 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.32 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.6 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.99 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  33.87 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  30.08 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  31.59 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.81 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.81 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.81 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>