203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4953 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 465 aa  882    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  42.51 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.33 
 
 		 384 aa  156  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 387 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 388 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.07 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.07 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 403 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.43 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 398 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 396 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  29.16 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 396 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.21 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.3 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 394 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 441 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 391 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.81 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 388 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.73 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  30.95 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  27.95 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  28.61 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 404 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  28.14 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  30.95 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  28.7 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  31.7 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 387 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  29.31 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  25.45 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  25.45 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 470 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  25.6 
 
 		 402 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  25.6 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  25.6 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  25.19 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 400 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  25.19 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  25.6 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  30.65 
 
 		 378 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  30.65 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  30.65 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  30.65 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  30.65 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  30.65 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 419 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>