219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2626 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  100 
 
 
392 aa  722    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
385 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 
381 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.86 
 
 
397 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  37.43 
 
 
383 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  36.86 
 
 
384 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
388 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  34.57 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  37.71 
 
 
383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
465 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  36.17 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
369 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 
383 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.93 
 
 
398 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
397 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
378 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.71 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
386 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.46 
 
 
386 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 
377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  35.98 
 
 
408 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
402 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  32.89 
 
 
396 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
396 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
391 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.85 
 
 
393 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  34.66 
 
 
403 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.93 
 
 
405 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.5 
 
 
388 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  37.01 
 
 
373 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
379 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  37.85 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.34 
 
 
417 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  35.05 
 
 
384 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.88 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.71 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 
392 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 
387 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
386 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  33.42 
 
 
385 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  33.42 
 
 
385 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  34.37 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  33.8 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.32 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  32.48 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36.41 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
389 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  36.04 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
387 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  33.15 
 
 
383 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 
379 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
389 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
398 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
373 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  34.69 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  34.69 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  35.15 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  30.5 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  39.43 
 
 
403 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  25.57 
 
 
397 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.42 
 
 
432 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  30.5 
 
 
402 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  30.5 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  35.34 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  30.5 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  30.5 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  30.5 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  30.24 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  35.88 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  31.04 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  35.2 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  36.78 
 
 
392 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  28.76 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  24.93 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  32.31 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  35.87 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  34.97 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  31.83 
 
 
382 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  36.09 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.59 
 
 
419 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  31.86 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  30.99 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  28.95 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  33.87 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  33.07 
 
 
383 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>