239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0940 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  87.81 
 
 		 402 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  87.81 
 
 		 402 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  100 
 
 		 403 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  87.56 
 
 		 402 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  99.75 
 
 		 403 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  99.26 
 
 		 403 aa  789    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  87.56 
 
 		 402 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  87.81 
 
 		 402 aa  680    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  87.56 
 
 		 402 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  87.81 
 
 		 402 aa  680    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  99.5 
 
 		 403 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  87.81 
 
 		 402 aa  680    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  99.5 
 
 		 403 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  87.53 
 
 		 404 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  86.93 
 
 		 375 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  51.55 
 
 		 391 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  51.84 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  53.2 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  50.81 
 
 		 414 aa  322  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  43.51 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  43.51 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  43.72 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  44.59 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  44.29 
 
 		 397 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 395 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  46.8 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 397 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 464 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.91 
 
 		 502 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  47.62 
 
 		 182 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  30.18 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  41.09 
 
 		 207 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.61 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 430 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  26.67 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.37 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  25.99 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.68 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 387 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>