234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2374 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  92.21 
 
 		 398 aa  708    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  787    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  47.22 
 
 		 390 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  46.74 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  46.74 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  46.74 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  46.74 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 404 aa  333  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  46.48 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  47.3 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  47.3 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  47.3 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  47.3 
 
 		 403 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  47.3 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  45.96 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  42.75 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  42.75 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  43.01 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  40.67 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  44.44 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 397 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  43.35 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 413 aa  195  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 413 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 480 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  49.4 
 
 		 182 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.75 
 
 		 502 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  37.62 
 
 		 207 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  28.1 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 387 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  29.05 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.42 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  28.14 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  26.86 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.65 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>