219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0602 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
413 aa  774    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  50.88 
 
 
425 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  52.67 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  57.78 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  47.47 
 
 
388 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
427 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 
464 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  44.89 
 
 
400 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  46.01 
 
 
433 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
397 aa  259  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 
446 aa  259  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  43.54 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  45.82 
 
 
417 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
443 aa  249  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 
402 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  39.48 
 
 
502 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
395 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  36.7 
 
 
404 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  46.53 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  35.5 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  34.96 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  36.43 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  36.43 
 
 
402 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
402 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  36.43 
 
 
402 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  36.43 
 
 
402 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  36.43 
 
 
402 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  36.43 
 
 
402 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  36.43 
 
 
402 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  35.7 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  35.7 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  35.7 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  35.43 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  35.17 
 
 
403 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  41.78 
 
 
404 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  33.49 
 
 
397 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
433 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  33.25 
 
 
397 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  33.25 
 
 
397 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  36.2 
 
 
375 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  33.92 
 
 
390 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  37.91 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
401 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
391 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  33.42 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  39.63 
 
 
282 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.86 
 
 
398 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.63 
 
 
384 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
387 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
387 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.07 
 
 
383 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.38 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.93 
 
 
417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
381 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.53 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  35.44 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  31.62 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.19 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
388 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
394 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
402 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 
391 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
394 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  38.82 
 
 
182 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
391 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.63 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.33 
 
 
396 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.82 
 
 
403 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.39 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.21 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
386 aa  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  33.07 
 
 
447 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
405 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  31.51 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.75 
 
 
432 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  33.92 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
397 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
392 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  31.23 
 
 
419 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  28.5 
 
 
396 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  32.39 
 
 
414 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.92 
 
 
400 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  33.17 
 
 
403 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.27 
 
 
384 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
465 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  29.9 
 
 
428 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
390 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>