240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3179 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  768    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 		 413 aa  325  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  56.89 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  51.65 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  57.23 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  52.49 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  37.37 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  38.22 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  40.96 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  40.96 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 402 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  40.96 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  40.96 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 404 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  40.56 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  39.26 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  39.26 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  39.26 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  36.77 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  36.51 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  36.77 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  39.26 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  39.26 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  39.14 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  42.47 
 
 		 282 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.33 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.47 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  43.35 
 
 		 182 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.97 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.95 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  32.88 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 386 aa  113  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.26 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  34.89 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.95 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.75 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.92 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  33.6 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  30.23 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>