243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3832 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  93.95 
 
 
396 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
397 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  68.43 
 
 
396 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  64.12 
 
 
384 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  63.87 
 
 
397 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  64.08 
 
 
397 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  49.33 
 
 
391 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
385 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
378 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  37.54 
 
 
392 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.81 
 
 
400 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  37.67 
 
 
441 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  36.46 
 
 
377 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
405 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
389 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  42.98 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  36.19 
 
 
400 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
402 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
398 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
377 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
379 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 
381 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
391 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  37.11 
 
 
383 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  33.42 
 
 
378 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
388 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  34.05 
 
 
378 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  34.05 
 
 
378 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  34.05 
 
 
378 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  34.05 
 
 
378 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  34.05 
 
 
378 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  35.16 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.51 
 
 
383 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  33.78 
 
 
378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  34.44 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
392 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.88 
 
 
385 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  32.6 
 
 
385 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  32.6 
 
 
385 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
379 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
383 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.14 
 
 
405 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  36.63 
 
 
392 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  37.94 
 
 
384 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
386 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  32.05 
 
 
383 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  29 
 
 
386 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33 
 
 
384 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
391 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
387 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  31.55 
 
 
398 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.03 
 
 
417 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
425 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
369 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
390 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
386 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.25 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
470 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.03 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  31.47 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  34.06 
 
 
403 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  31.71 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  32.21 
 
 
393 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
408 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.28 
 
 
408 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  33.16 
 
 
383 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  31.39 
 
 
387 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  31.39 
 
 
387 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  32.88 
 
 
419 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.27 
 
 
396 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.77 
 
 
388 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  31.11 
 
 
387 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  34.41 
 
 
409 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  30.05 
 
 
386 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  32 
 
 
404 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
407 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  35.45 
 
 
439 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
385 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  36.8 
 
 
379 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
395 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  35.02 
 
 
382 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.95 
 
 
432 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.04 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  34.56 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
387 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  34.65 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.91 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  31.18 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  36.18 
 
 
373 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  35.36 
 
 
404 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  35.36 
 
 
404 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  31.71 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>