215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0565 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  853    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  57.38 
 
 		 502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  35.01 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  28.08 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  27.48 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  27.48 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  28.41 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  31.4 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  31.4 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  31.64 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  31.4 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 404 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  31.68 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 398 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  29.73 
 
 		 390 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  29.95 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  29.95 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 375 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  30.19 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  30.19 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  30.19 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  57.42 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  28.34 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  32.42 
 
 		 282 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  29.25 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  36.42 
 
 		 182 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  25.31 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.92 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  29.95 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  27.92 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  27.54 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 396 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  28.27 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 396 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  26.83 
 
 		 414 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>