216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  100 
 
 		 447 aa  847    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  60.05 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  58.6 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  55.66 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  52.78 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  58.38 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  54.24 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  55.88 
 
 		 414 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 439 aa  294  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  45.26 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  44.47 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  52.51 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 386 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  37.25 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.43 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 381 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.2 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  32.44 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.27 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 465 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  31.72 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 397 aa  123  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.5 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  29.97 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  28.68 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.83 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.95 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 396 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 391 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 397 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  31.37 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  29.19 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.88 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  26.77 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 373 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  26.97 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 385 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 400 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>