230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0461 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
381 aa  727    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  70.06 
 
 
391 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
385 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
388 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  42.86 
 
 
441 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
387 aa  225  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  41.55 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
390 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  42.15 
 
 
383 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  44.09 
 
 
393 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  43.01 
 
 
388 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
392 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  39.02 
 
 
417 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 
377 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  40.5 
 
 
384 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  38.07 
 
 
385 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  43.17 
 
 
395 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
389 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  39.52 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  37.53 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  37.53 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
405 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  37.94 
 
 
384 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  33.7 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  32.89 
 
 
405 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
402 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
386 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
403 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  38.38 
 
 
398 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  39.56 
 
 
383 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  41.42 
 
 
392 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  40.37 
 
 
403 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  40.95 
 
 
403 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  38.18 
 
 
401 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  39.51 
 
 
383 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  37.01 
 
 
397 aa  186  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  36.36 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  36.63 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  37.67 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  37.75 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  37.4 
 
 
378 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  38.26 
 
 
383 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
387 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  37.4 
 
 
378 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  37.4 
 
 
378 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  37.4 
 
 
378 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  37.4 
 
 
378 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
387 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  37.14 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  36.92 
 
 
419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  41.38 
 
 
384 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  41.38 
 
 
384 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  41.38 
 
 
384 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 
390 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  38.44 
 
 
391 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
379 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  37.81 
 
 
396 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
391 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  36.84 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  42.74 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  37.33 
 
 
400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  40.82 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  37.12 
 
 
382 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  39.22 
 
 
400 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  38.86 
 
 
377 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
387 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  39.34 
 
 
377 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 
385 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  39.26 
 
 
379 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
396 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
397 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  36.63 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.46 
 
 
392 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  31.97 
 
 
391 aa  163  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  34.41 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
369 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  33.7 
 
 
404 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  35.47 
 
 
396 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  38.59 
 
 
404 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  38.59 
 
 
404 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  38.98 
 
 
403 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
427 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
411 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  36.49 
 
 
413 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
433 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  30.54 
 
 
387 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  30.54 
 
 
387 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
384 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  34 
 
 
428 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  30.85 
 
 
387 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>