217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4139 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  85.71 
 
 		 397 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 425 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 413 aa  285  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  39.47 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  39.21 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  39.21 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  37.74 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  38.95 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 375 aa  239  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 480 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  37.67 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  37.67 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  37.67 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  37.4 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  37.67 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  39.8 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 		 390 aa  232  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  36.6 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  36.6 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  36.6 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 433 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 395 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 391 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  38.83 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  37.08 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  32.98 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  36.54 
 
 		 282 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  40.62 
 
 		 182 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.01 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 419 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.36 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 388 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.29 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.69 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  31.59 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 470 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  29.44 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  31.1 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  31.94 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>