201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8344 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  38.92 
 
 
413 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
400 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  38.16 
 
 
396 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  34.76 
 
 
393 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  29.09 
 
 
384 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
403 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.48 
 
 
397 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
381 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
386 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
398 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.5 
 
 
386 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
387 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
427 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.29 
 
 
397 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
465 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.78 
 
 
417 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.62 
 
 
382 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  26.88 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  28.75 
 
 
385 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  26.95 
 
 
404 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  26.63 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  27.74 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  27.74 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
383 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  26.63 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  26.63 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  26.63 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  26.63 
 
 
402 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  26.63 
 
 
402 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  26.37 
 
 
402 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.08 
 
 
419 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  27.44 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  30.33 
 
 
396 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
436 aa  86.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  28.08 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  28.21 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  26.5 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  26.56 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  26.5 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.79 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  27.04 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  26.61 
 
 
400 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  27.05 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  25.45 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  27.05 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  27.98 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  29.53 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  25.92 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  27 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  26.8 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  26.85 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  28.62 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  27.43 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  30.71 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  27.1 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  24.59 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
407 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  25.7 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  28.94 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  24.17 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  28.86 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  27.01 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  24.11 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  26.06 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  28.16 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  22.97 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.07 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.06 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>