229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2920 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  100 
 
 
382 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  55.15 
 
 
386 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  54.35 
 
 
392 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  49.16 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  48.88 
 
 
383 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 
377 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
379 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  50.69 
 
 
383 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  47.04 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
389 aa  252  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  47.49 
 
 
384 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 
389 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
387 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  44.54 
 
 
384 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  44.54 
 
 
384 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  44.54 
 
 
384 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  39.61 
 
 
385 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  39.34 
 
 
387 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  39.11 
 
 
387 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  39.11 
 
 
387 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  39.04 
 
 
385 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  39.04 
 
 
385 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  37.99 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  37.99 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  37.99 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  37.99 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  37.99 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  37.99 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  37.71 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  40.11 
 
 
389 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  41.79 
 
 
379 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  40.4 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  40.85 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  37.15 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  41.13 
 
 
377 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
388 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
405 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
386 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
381 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  32.25 
 
 
405 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.04 
 
 
392 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.93 
 
 
386 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
403 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
383 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.33 
 
 
408 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.71 
 
 
393 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
369 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 
391 aa  156  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  34.08 
 
 
400 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.11 
 
 
384 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.43 
 
 
386 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
379 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36 
 
 
400 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  33.14 
 
 
391 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.1 
 
 
383 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  31.98 
 
 
432 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
415 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.81 
 
 
383 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.67 
 
 
396 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.94 
 
 
417 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
390 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  28.96 
 
 
397 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  33.33 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  34.6 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.88 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.83 
 
 
403 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.43 
 
 
384 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
387 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  30.87 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.73 
 
 
396 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32.96 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
411 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  29.18 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  30.11 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  32.43 
 
 
373 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
470 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
391 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.48 
 
 
402 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
402 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.48 
 
 
402 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.48 
 
 
402 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.2 
 
 
402 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.48 
 
 
402 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.2 
 
 
402 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.2 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
394 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
408 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>