231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0923 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 385 aa  761    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  53.87 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 405 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  41.67 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  39.47 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  36.51 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.2 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.96 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.2 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  35.98 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 391 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 382 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.83 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.05 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 409 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.25 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  35.52 
 
 		 401 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.36 
 
 		 408 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  36.9 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  36.39 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.51 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.42 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  30.19 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  30.19 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  34.45 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  29.97 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  36.24 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.68 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>