222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7621 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 398 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 403 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.92 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.61 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  36.69 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.26 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.81 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  37.25 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  34.49 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  36.36 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  34.66 
 
 		 403 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.24 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  33 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.83 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.83 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.83 
 
 		 402 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.56 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.18 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  35.64 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.77 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  33.97 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5931  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0299912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.5 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>