235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3265 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  66.32 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 		 389 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  71.35 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  71.35 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  71.35 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 		 387 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  54.69 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  53.89 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 		 377 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 392 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  52.88 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 389 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  48.55 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  48.55 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  48.55 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  48.55 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  48.55 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  48.55 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  51.9 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  48.28 
 
 		 378 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  52.19 
 
 		 401 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  46.54 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  52.29 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  51.35 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 388 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  35.23 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.71 
 
 		 397 aa  176  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.06 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  39.14 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  39.94 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  33.76 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  31.09 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.15 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  34.29 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 419 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.87 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  30.38 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  30.38 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  30.38 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  30.85 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  32.74 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  30.11 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>