222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1443 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  100 
 
 
384 aa  741    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  100 
 
 
384 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  100 
 
 
384 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  67.61 
 
 
389 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  71.35 
 
 
384 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  69.44 
 
 
389 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  54.97 
 
 
383 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  55.52 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  56.08 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  52.42 
 
 
392 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
377 aa  322  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  51.89 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 
386 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 
378 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  48.22 
 
 
389 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  51.22 
 
 
401 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  51.48 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  51.75 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  46.07 
 
 
378 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  46.07 
 
 
378 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  46.07 
 
 
378 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  46.07 
 
 
378 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  46.07 
 
 
378 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  48.36 
 
 
379 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  46.07 
 
 
378 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  45.8 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  44.44 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  40.1 
 
 
387 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  42.59 
 
 
385 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  39.84 
 
 
387 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  39.84 
 
 
387 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  49.86 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  42.4 
 
 
385 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  42.4 
 
 
385 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  45.51 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 
405 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
385 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
387 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
386 aa  187  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
379 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  30.14 
 
 
386 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.7 
 
 
384 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.25 
 
 
396 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.05 
 
 
397 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.61 
 
 
398 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  39.33 
 
 
400 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
390 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  35.18 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.57 
 
 
393 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.39 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.95 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.24 
 
 
391 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.33 
 
 
417 aa  162  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
387 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
387 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.08 
 
 
441 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 
407 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
396 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.15 
 
 
400 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
397 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
383 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
403 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.91 
 
 
405 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.7 
 
 
386 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
369 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.5 
 
 
383 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.17 
 
 
403 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
385 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.95 
 
 
373 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.71 
 
 
383 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  33.24 
 
 
408 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  33.07 
 
 
403 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  30.95 
 
 
432 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
470 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  29.02 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  32.28 
 
 
419 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.83 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.83 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.83 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.83 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.83 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.83 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  29.83 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.61 
 
 
462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.46 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.6 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  34.5 
 
 
403 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.87 
 
 
392 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
390 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  28.46 
 
 
411 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>