210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6975 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  97.4 
 
 		 385 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  97.4 
 
 		 385 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  100 
 
 		 385 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  63.66 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  63.4 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  63.4 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  63.4 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  63.13 
 
 		 378 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  63.4 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  63.4 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  64.84 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  61.54 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  55.74 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  53.95 
 
 		 401 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  53.23 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 377 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  42.66 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  35.29 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.2 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 396 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.84 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.06 
 
 		 397 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.25 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.86 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.11 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.27 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.84 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  31.25 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.16 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  31.27 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  29.46 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  29.62 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  33.6 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>