227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1853 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  100 
 
 		 417 aa  801    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  47.31 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  43.85 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  44.7 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  36.53 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 441 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.53 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.6 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.72 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  35.1 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  38.08 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.4 
 
 		 451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  33.95 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.44 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.19 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  35.14 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  35.14 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  35.14 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  35.14 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  35.14 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  35.14 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  34.86 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  32.36 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  34.32 
 
 		 377 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  33.8 
 
 		 447 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.02 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.42 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6301  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 519 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>