249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5300 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  93.65 
 
 		 394 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  61.95 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  51.67 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.38 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  28.11 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.62 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.62 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.62 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.62 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  27.58 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  29.74 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  29.74 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  29.47 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  27.95 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  27.95 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  26.59 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  28.42 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  29.47 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  28.42 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  28.42 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  26.11 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  29.23 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.63 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  29.35 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  29.75 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  29.08 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  25.57 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  27.22 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.35 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  27.45 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  27.05 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  27.05 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  28.29 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>