258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2780 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 395 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  66.58 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 		 427 aa  318  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  50.66 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  47.33 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  47.33 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  47.33 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  47.17 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  47.17 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  47.06 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  46.9 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  46.63 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  46.63 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  47.96 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  45.28 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  42.12 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  41.82 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  41.82 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  42.67 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  41.41 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 413 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  46.9 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  34.63 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  44.2 
 
 		 182 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.22 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.65 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 396 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3049  sugar (and other) transporter, N-terminal region  38.46 
 
 		 207 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.14 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.45 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  30.67 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>