209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0289 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  786    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  52.33 
 
 		 414 aa  361  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  55.41 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  52.51 
 
 		 400 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  49.5 
 
 		 447 aa  322  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  50.41 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  49.72 
 
 		 414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  49.31 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  39.79 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  41.28 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  35.31 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.33 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.17 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.96 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.44 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  32.07 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  29 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  28.42 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  28.23 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  27.85 
 
 		 502 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  28.49 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  31.32 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.83 
 
 		 462 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  25.84 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  27.03 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  26.47 
 
 		 396 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.35 
 
 		 451 aa  89.7  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  25.2 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>