136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0419 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  100 
 
 
394 aa  785    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  93.65 
 
 
394 aa  691    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  64.51 
 
 
386 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  59.9 
 
 
392 aa  485  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  49.63 
 
 
414 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  52.82 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  52.19 
 
 
393 aa  396  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 
394 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  50.99 
 
 
408 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 
393 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  50.41 
 
 
389 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  48.4 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  39.47 
 
 
390 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
425 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  32.31 
 
 
395 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  33.61 
 
 
395 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  24.91 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.69 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  23.88 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  23.88 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  23.88 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  24.32 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  24.66 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  24.05 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  24.05 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  23.6 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  25.58 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  23.14 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  23.98 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  25.51 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  22.58 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
422 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.39 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  25.26 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.1 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  27.47 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  27.47 
 
 
403 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.27 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  24.61 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  27.47 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  27.47 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  26.17 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  26.92 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.95 
 
 
529 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  20.7 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  24.58 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25.84 
 
 
274 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  26.11 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.89 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  26.47 
 
 
405 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  22.73 
 
 
384 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  24.22 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.28 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  21.37 
 
 
432 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.27 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.85 
 
 
398 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  21.73 
 
 
386 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.77 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  23.08 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  23.73 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  23.78 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  23.47 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  23.47 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  25 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  24.34 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  24.9 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.81 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  24.9 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  22.7 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  20.12 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.21 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  21.47 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  26.43 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.14 
 
 
397 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  21.01 
 
 
405 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
405 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 
385 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  24.01 
 
 
397 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.02 
 
 
425 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  20.94 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  24.22 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.57 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  18.61 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>